摘要：新疆裸重唇鱼和斑重唇鱼为新疆维吾尔自治区土著鱼类。21世纪初,由于利益驱使和人类活动,资源遭到严重破坏,目前两者分别列为自治区Ⅰ、Ⅱ级水生野生保护动物。自治区渔业部门也针对其资源量开展增殖放流活动,但在物种资源保护研究方面进展缓慢,未见种群遗传多样性相关研究报道。本研究采集新疆裸重唇鱼和斑重唇鱼鳍条样本,利用16对同亚科鱼类微卫星引物对两个物种进行了种内多态性分析和种质鉴定。遗传参数分析发现,两群体平均观测杂合度(Ho)分别为0.454和0.367,平均期望杂合度(He)分别为0.397和0.245,斑重唇鱼的多态信息含量(PIC)范围在0.180~0.616之间,新疆裸重唇鱼的多态信息含量(PIC)范围在0.124~0.740之间,斑重唇鱼种群的遗传多样性要高于新疆裸重唇鱼,但遗传多样性均处于较低水平,需加强保护。