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中间锦鸡儿CiATAF1基因的亚细胞定位及表达分析

王燕飞; 红格日其其格; 王光霞; 王瑞刚; 李国婧 内蒙古农业大学生命科学学院; 内蒙古呼和浩特010018; 内蒙古植物逆境生理与分子生物学重点实验室; 内蒙古呼和浩特010018; 内蒙古抗逆植物遗传资源利用与分子改良科技创新团队; 内蒙古呼和浩特010018
  • 中间锦鸡儿
  • ciataf1
  • 基因表达
  • 亚细胞定位
  • 非生物胁迫

摘要:为研究NAC转录因子在非生物胁迫条件下的表达,以中间锦鸡儿为材料,克隆并分析了NAC转录因子家族CiATAF1基因。该基因ORF全长为873bp,编码291个氨基酸,由2个内含子和3个外显子构成,具有典型NAC结构域。染色体步移法获得CiATAF1基因启动子826bp,该启动子含有光、激素、厌氧诱导等多种响应元件。经拟南芥叶片原生质体瞬时表达分析亚细胞定位,CiATAF1基因主要定位于细胞核中。荧光定量分析表明:CiATAF1基因表达具有组织特异性,相比于中间锦鸡儿根和茎,在叶部表达量最高;在干旱、盐、冷、ABA处理下,CiATAF1基因表达量增加,推测该基因可能与非生物胁迫应答相关。CiATAF1同模式植物拟南芥及豆科其他植物的同源基因做多重序列分析,序列一致性为81.14%,表明ATAF1基因序列结构相对保守。生物信息学分析CiATAF1蛋白质属于不稳定的亲水蛋白,二级结构主要由α-螺旋、β折叠、无规则卷曲构成。研究结果对挖掘中间锦鸡儿抗非生物胁迫的基因和深入分析逆境胁迫机理具有重要意义。

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